2019年6月，科技部、财政部发布国家科技资源共享服务平台优化调整名单，国家生态科学数据中心（National Ecosystem Science Data Center,简称NESDC）正式成立。 2019年6月，成立CERN数据中心 ；2019年7月，成立中国科学院生态科学数据中心；2019年8月，国家生态科学数据中心2020-2025年建设方案通过论证。

国家生态科学数据中心的前身为2011年国家财政部、科技部认定的国家科技基础条件平台——国家生态系统观测研究网络（National Ecosystem Research Network of China，简称CNERN）。

中心定位

以CNERN国家站为基础，生态系统观测研究数据为核心，拓展部门台站和专项观测网络，整合台站-区域-全国生态系统观测研究数据产品，打造具有国内外先进水平的国家级科学数据中心，支撑国家生态文明建设和生态系统学科发展。