国家园艺种质资源库由2个国家中期库、21个国家种质圃和13个地方特色资源库（圃）组成，涵盖了198个园艺种类、637个植物学种。目前库内保存有7.5万余份园艺实物资源，6万余条园艺种质数字化资源，6万余张园艺种质图片资源，涉及落叶果树、常绿果树、有性繁殖蔬菜、无性繁殖蔬菜、水生蔬菜、西瓜甜瓜、草莓七大类群。